Dopo l'allontanamento di Garret, la squadra cerca di adattarsi alle rigorose linee guida del capo ad interim Jack Slokum. Woody fa di tutto per prendere il killer dei poliziotti che lo ha quasi reso disabile, ma così incrina il rapporto con Jordan.

Una showgirl di Las Vegas si lancia da una finestra dell'obitorio e Jordan e Woody chiedono ai loro amici del Casinò Montecito di aiutarli a risolvere il caso. Josh Duhamel e Vanessa Marcil sono le guest star di questo episodio di "Crossing Jordan".

Una tempesta imperversa su Boston e i soccorritori cercano tre bambini di 10 anni scomparsi nella National Forest. Sebbene influenzata, Jordan non può fare a meno di seguire un'ultima pista per trovare i bambini e finisce in una miniera abbandonata.

L'indagine di Jordan su un detenuto morto la porta a interrogarsi sulle tremende condizioni del sistema sanitario del carcere. Lily, alle prese con le recenti rivelazioni su sua madre, aiuta la sorella di un assassino a evitare conseguenze penali.

Jordan indaga sul leader di una setta religiosa sospettato di aver ucciso suo figlio e la sua ex moglie. Woody va in terapia per via del suo carattere e incontra la nuova psicologa. Bug e Lily affrontano un caso di scambio di identità.

Woody e Garret riaprono un caso di persone scomparse dopo che viene trovato un corpo e l'ex studente della vittima ammette il crimine. Jordan e J.D. Pollack si innamorano, ma un caso fa venire dei dubbi a Jordan sul significato di amore e impegno.

Un emulatore sta imitando i crimini del killer di Mass Pike e Woody e Jordan si ritrovano faccia a faccia con il killer originale per chiedergli aiuto. Il killer inizia a svelare le emozioni di Jordan e a individuare i suoi problemi nell'intimità.

Woody indaga sull'omicidio di un poliziotto e crede di aver chiuso il caso. Ma Jordan trova nell'auto del sospettato un cellulare che il giorno prima non c'era e tutti credono che Woody abbia falsificato le prove. Jordan riuscirà a scagionare Woody?

Jordan (Jill Hennessy) si imbatte in un vecchio caso e scopre che la vittima potrebbe non essere davvero morta. Nel frattempo, Garret e Woody indagano su Henry Bishop, che sapeva che suo fratello Thomas era stato assoldato per uccidere sua moglie.

Jordan e Woody trascorrono del tempo insieme per risolvere un omicidio di 100 anni prima in un bed and breakfast con un passato sordido. Nel frattempo, Bug si ingelosisce quando Lily annuncia di avere un appuntamento con Jeffrey, il viceprocuratore.

Il posto di Garret potrebbe essere a rischio per via di un'accusa di guida in stato d'ebbrezza la sera prima di comparire come testimone in un caso molto importante. Jordan e Woody si chiedono come andrà la loro relazione, se mai andrà avanti.

Jordan e Woody indagano sulla morte di due soldati: uno in Iraq e uno a Boston. Garret discute con sua figlia delle sue scelte in materia di fidanzati. Jordan scopre che J.D. nasconde un segreto e Nigel indaga su un vecchio caso di rapimento.

Garret resta scioccato quando scopre l'identità del corpo trovato sulla scena del crimine e il fatto che le prove rinvenute coinvolgono nel caso sua figlia, che ha assistito a una sparatoria legata a una banda ed è scomparsa. La troveranno in tempo?

Una bomba è esplosa su un treno a Boston, causando parecchie vittime, tra cui dei bambini in una scuola. Il peggio, però, è che un'altra bomba è pronta a esplodere. Jordan, Woody e la squadra corrono per trovarla prima che causi altre vittime.

Durante un incendio boschivo perdono la vita alcuni pompieri. Il team collega l'incidente a un errore umano ai piani alti del comando. Garret cerca di convincere sua figlia a rimanere in riabilitazione. Una tragedia colpisce la nuova auto di Bug.

Una ragazza di 13 anni è testimone dell'omicidio di suo padre nell'appartamento sopra quello di Jordan, che si ritrova in pericolo. Nel frattempo, Lily e Garret indagano sul decesso di un uomo bianco e di una donna afroamericana morti insieme.

Woody e Lu fanno squadra per scovare il killer di una ragazza. Ipotizzano che l'omicida abbia turbe psichiche e viva in un centro di recupero e le indagini si complicano. Mentre lo Stato cerca una nuova casa per la ragazza, Jordan se ne prende cura.

Un giocatore professionista di baseball è accusato di stupro e Jordan e Lu indagano, ma solo una di loro crede alla vittima. Nigel e Bug cercano i familiari di un pilota il cui corpo è stato trovato congelato 40 anni dopo la sua morte.

Woody e Jordan si occupano della morte di una presunta fautrice di miracoli. Bug indaga sull'insolita morte di un lavavetri; Lily rivaluta la sua relazione con l'assistente del procuratore distrettuale Jeffrey Brandau.

Mentre cerca di restituire degli effetti personali, Garret fa una sconcertante scoperta... un ragazzo tenuto ostaggio. Jordan e Lu si scontrano con il custode dell'obitorio; Lily, concentrata sui preparativi del matrimonio, incappa in Bug.

Il mattino dopo un party, Jordan si sveglia con il cadavere di J.D. al suo fianco, ma non ricorda nulla della notte precedente. Accusata di omicidio, Jordan si rivolge ai suoi amici per capire cosa sia successo.