Regia: Robert Duncan Mcneill, Allan Kroeker. Cast: Zachary Levi, Yvonne Strahovski, Joshua Gomez, Sarah Lancaster, Adam Baldwin, Vik Sahay, Scott Krinsky, Bonita Friedericy, Ryan Mcpartlin.
Shaw è scappato di prigione per vendicarsi di Sarah e Chuck, ma soprattutto per impossessarsi della CIA. Sta terrorizzando il mondo perchè ha attivato un virus che sta cancellando tutti i dati dagli hard disk. Il suo scopo è creare l'Intersect 3.0. Morgan riuscirà a liberare Sarah e sarà proprio Ellie a dare il colpo finale a Shaw.
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