Nella terza stagione, dopo circa una anno dagli ultimi eventi, Liz e Rosa si trovano a Los Angeles, mentre Max è totalmente preso da qualsiasi attività che la cittadina abbia da offrirgli. Assieme ad Isobel e Michael cerca di capire se può considerare lo straniero esteticamente uguale a lui un alleato oppure un nemico. Alex, dopo essersi allontanato da Roswell per occuparsi del progetto Shepard, rientra in città. Insieme i ragazzi dovranno anche difendersi da un omicidio che non è ancora avvenuto.